Регламентът въвежда извършването на системни (задължителни) проверки на всички категории пътници, в това число и на гражданите на ЕС и техните документи за пътуване, при преминаването им през граничните пунктове. В тази връзка Главна дирекция "Гранична полиция" уведомява гражданите, че е възможно увеличаване на времето за изчакване в зоните на ГКПП за извършване на тези гранични проверки, съобщават от МВР.

Съгласно Регламента може да се допусне изключение от правилото за системни проверки на вътрешни сухопътни граници на държавите-членки. На тези граници могат да се извършват несистемни проверки спрямо лицата, ползващи се от правото на свободно движение, съгласно правото на ЕС, основани на оценката на риска.